chemical-file-converter
Installation
SKILL.md
Chemical File Converter
化学文件格式转换技能，支持多种常见化学文件格式之间的互转。
支持的文件格式
| 格式 | 扩展名 | 说明 |
|---|---|---|
| XYZ | .xyz |
简单坐标格式，包含原子类型和 3D 坐标 |
| Gaussian Input | .gjf, .com |
Gaussian 计算输入文件 |
| MDL Molfile | .mol |
单个分子的 2D/3D 结构 |
| Structure Data | .sdf, .sd |
多个分子的结构数据文件 |
| Protein Data Bank | .pdb |
生物大分子结构 |
| Tripos Mol2 | .mol2 |
Tripos 分子格式 |
| SMILES | .smi, .smiles |
线性分子表示 |
| CML | .cml |
化学标记语言 (XML) |
| MOPAC | .mop, .zmt |
MOPAC 输入文件 |
使用方法
Related skills
More from internscience/chemclaw
molecular_properties_predictor
预测小分子多种物化性质（沸点、折射率、密度、黏度、表面张力等），当前已真实接入 bamboo_mixer 单分子物性模型后端。
14literature-parsing
将 PDF 文献转换为 Markdown 文件，并提取所有图表图片。使用 MinerU (opendatalab) 进行工业级高质量解析。
14reaction-data-extraction
从 PDF 文献中提取化学反应数据，特别是反应条件优化信息。支持提取反应物、产物、催化剂、溶剂、温度、时间、产率等，并输出结构化 CSV 文件。使用 MinerU + NLP + 规则匹配进行精确提取。
14mineru-pdf-converter
|
13adme-prediction
ADME 性质预测工具。预测分子的吸收、分布、代谢、排泄性质，包括 Caco-2 通透性、PAMPA、HIA、Pgp 抑制、生物利用度、亲脂性等。使用 Morgan 指纹 + Random Forest/XGBoost。当用户提到 ADME 预测、药物性质、通透性、吸收、代谢等时触发。
13nmr-prediction
Predict liquid-phase ¹H and ¹³C NMR chemical shifts from a SMILES string using NMRNet (deep learning, SE(3)-Transformer). Outputs per-atom shift values (ppm) and Lorentzian-broadened spectrum PNG files.
13