mol-2d-viewer
Installation
SKILL.md
Molecular Structure Visualizer
将 SMILES 字符串或化学名称转换为分子结构图，支持聚合物 2D 结构绘制。
触发条件
- 用户提供 SMILES 并要求可视化
- 提到"分子结构"、"可视化"、"draw molecule"
- 说"SMILES 转图片"、"显示结构"
- 提供聚合物名称或 SMILES
功能
- ✅ SMILES → 分子结构图
- ✅ IUPAC 名称 → 结构图（自动通过 OPSIN 转 SMILES）
- ✅ 聚合物支持 - 正确渲染聚合物重复单元
- ✅ 输出 PNG 或 SVG 格式
- ✅ 可自定义尺寸、样式
- ✅ 批量生成
Related skills
More from internscience/chemclaw
molecular_properties_predictor
预测小分子多种物化性质（沸点、折射率、密度、黏度、表面张力等），当前已真实接入 bamboo_mixer 单分子物性模型后端。
14literature-parsing
将 PDF 文献转换为 Markdown 文件，并提取所有图表图片。使用 MinerU (opendatalab) 进行工业级高质量解析。
14reaction-data-extraction
从 PDF 文献中提取化学反应数据，特别是反应条件优化信息。支持提取反应物、产物、催化剂、溶剂、温度、时间、产率等，并输出结构化 CSV 文件。使用 MinerU + NLP + 规则匹配进行精确提取。
14mineru-pdf-converter
|
13adme-prediction
ADME 性质预测工具。预测分子的吸收、分布、代谢、排泄性质，包括 Caco-2 通透性、PAMPA、HIA、Pgp 抑制、生物利用度、亲脂性等。使用 Morgan 指纹 + Random Forest/XGBoost。当用户提到 ADME 预测、药物性质、通透性、吸收、代谢等时触发。
13nmr-prediction
Predict liquid-phase ¹H and ¹³C NMR chemical shifts from a SMILES string using NMRNet (deep learning, SE(3)-Transformer). Outputs per-atom shift values (ppm) and Lorentzian-broadened spectrum PNG files.
13