ms-spectra-simulation
Installation
SKILL.md
MS Spectra Simulation Skill
When to use this
Use this skill when the user provides a SMILES string and wants:
- Predicted MS/MS spectrum
- Raw MSP output downloaded from fioRa
- Standard MGF output
- A quick stick-spectrum PNG visualization
- Simple defaults without manually preparing a CSV
Inputs
- SMILES string (required)
--name(optional, default:mol1)--precursor(optional, default:[M+H]+)--ce(optional, default:20)--instrument(optional, default:HCD)--output-stem(optional, default:predicted_ms)--plot / --no-plot(optional, default: plot enabled)--show-title / --no-show-title(optional, default: no title on the plot)
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