Scientific Proteomics & Mass Spectrometry

LC-MS/MS ベースのプロテオミクス・メタボロミクス質量分析データを対象に、 スペクトル前処理→ペプチド/化合物同定→定量→差次的解析の 標準パイプラインを提供する。

When to Use

• LC-MS/MS プロテオミクスデータのペプチド同定・蛋白質定量が必要なとき
• TMT/SILAC/LFQ による差次的蛋白質発現解析を行うとき
• 翻訳後修飾 (リン酸化, ユビキチン化, アセチル化) マッピングが必要なとき
• スペクトルライブラリ検索・分子ネットワーキングを行うとき
• 化合物同定 (HMDB/MassBank/GNPS) が必要なとき

Quick Start

1. MS データ前処理 (pyOpenMS)